大石鸡是我国特有种，分布区狭窄，石鸡为广布种，两者都是我国北方干旱、半干旱荒漠环境的指示鸟类。利用线粒体DNA细胞色素b基因标记分析了大石鸡106 个、石鸡48 个样品，获得大石鸡单倍型9 个，石鸡单倍型13 个；在大石鸡种群中发现8 个个体呈现石鸡基因模式(Hap_1和Hap_2)，但是在石鸡种群中没有发现大石鸡的基因模式，确认为石鸡和大石鸡之间的渐渗杂交；确认杂交带从六盘山脉向南到陇南地区的礼县一带，杂交带长度为400 km，宽度为130 km。结果表明目前渐渗杂交对大石鸡种群遗传多样性影响不大，在不长的进化时期内，对增加物种多样性是有好处的。建议进行长期野外监测，以便弄清发生渐渗杂交的野外生态学数据，为物种进化研究提供参考依据。