本文构建了城乡统筹发展视角下的重庆市生态环境评价指标体系，并利用时序主成分分析法对重庆市生态环境系统行为在1998—2008这11年间的演变进行了实证评价研究。结果表明：1）城乡背景下重庆市生态环境整体水平在此$$年间呈持续良性发展趋势，但变化速率有起伏改变；2）系统演变的协调度较差，在这期间呈“双峰态”变化，演变峰值分别出现在2001年和2006年；3）重庆市直辖以来城镇子系统的环境发展态势较好，乡村子系统生态环境有进一步恶化的趋势，今后一段时间内要密切注意防止乡村子生态环境子系统出现负向演化。重庆市城乡生态环境子系统间的关系可以用方程式F=0.745 6F1-0.731 1F2来表征，F、F1和F2分别为城乡大系统综合评价值、城镇子系统评价值和乡村子系统评价值。