采用改进的数据包络分析法（超效率DEA）计算出中国30 个省在不同时期的生态效率，运用全局和局部空间相关分析方法（ESDA）研究中国生态效率的空间自相关性和空间异质性。结果表明：中国生态效率东、中、西区域差异明显，东部发达地区生态效率高，中西部欠发达地区生态效率低；2004—2012 年全局自相关 Moran’sⅠ值均为正数，表明省域之间生态效率呈现正相关的空间集聚分布，2004—2012 年生态效率的空间聚集程度先略有缩小后加强；区域生态效率的空间异质性主要表现为生态效率的“热点”区相对稳定，主要集中在北部、东部和南部沿海地区，“冷点”区主要集中在东北、大西南、大西北、长江中游和黄河中游地区；生态效率的空间差异与区域经济发展水平、产业结构和能源消耗强度等密切相关，基于空间探索性数据分析方法研究我国区域生态效率的空间异质性，为国家制定提高区域生态效率相关调控政策提供参考。