大熊猫与北极熊基因组中V1R基因的分布与序列分析
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商丘师范学院 生物与食品学院,河南 商丘 476000;中国大熊猫保护研究中心,四川 都江堰 611830;重庆师范大学 生命科学学院 重庆市动物生物学重点实验室,重庆 401331

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Distribution and Sequence Analysis of V1R Gene in Giant Panda and Polar Bear Genome
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    【目的】对大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)和北极熊(Ursusmaritimus)的犁鼻器受体基因V1R 进行筛选和生物信息学分析。【方法】用已报道过的小鼠(Mus musculus)和大鼠(Ruttus norvegicus)全长V1R 基因作为查询序列,分别检索大熊猫和北极熊基因组序列,并将得到的大熊猫和北极熊V1R 基因序列与从NCBI下载已报道的狗(Canis lupus)、大鼠、小鼠和猫(Felis catus)的V1R 基因序列一起用邻接法重建系统发育关系(Bootstrap值设为1000)。【结果】大熊猫基因组中共有72个V1R 基因,其中13个V1R 基因序列包含完整的开放阅读框架;北极熊基因组中有24个V1R 基因;大熊猫和北极熊V1R 基因在整个基因组上分布并不集中,从系统发育树上看,不同物种之间V1R 基因有很大分化。【结论】不同的物种之间的V1R 基因存在一定的分化,大熊猫和北极熊在进化过程中均存在V1R 基因的大量丢失情况。

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引用本文

黄杰,杨波,曹亚茹,唐丹,黄炎,杨承忠
.大熊猫与北极熊基因组中V1R基因的分布与序列分析
[J].重庆师范大学学报自然科学版,2018,(5):48-

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