【目的】考察体外颜色标记对两种喜集群鲤科(Cyprinidae)鱼类有氧运动能力的影响，并比较这两种鱼类对颜色标记的反应差异。【方法】以鲤科鱼类锦鲫（Carassius auratus）和中华倒刺鲃（Spinibarbus sinensis）为实验对象，将实验鱼标记前后作为对照和处理，测定两种鱼类的临界游泳速度（Ucrit）、相对临界游泳速度（Ur）和最大代谢率（MMR）。【结果】1) 颜色标记前后，锦鲫和中华倒刺鲃的Ucrit和Ur均无明显变化且保持较高的重复性，但中华倒刺鲃在标记前的Ucrit明显高于锦鲫的Ucrit。2) 颜色标记前后，两种鱼的MMR均无明显变化。【结论】研究表明体外颜色标记对锦鲫和中华倒刺鲃的有氧运动能力均无影响，该方法可较好地运用于鱼类群体行为学的相关研究。