水稻Os01g61900基因的生物信息学解析及表达分析
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国家自然科学基金青年科学基金项目(No.31800238);重庆市自然科学基金创新发展联合基金项目(No.CSTB2023NSCQ-LZX0024);重庆市教育委员会科学技术计划研究项目青年项目(No.KJQN201900509,No.KJQN202100536)


Bioinformatics and Expression Analysis of Rice Gene 〖STHX〗Os01g61900
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    水稻(Oryza sativa)Os01g61900基因编码一个含CCT结构域的蛋白,而编码该类蛋白的基因家族大多参与了水稻的开花调控从而影响水稻的抽穗期和最终产量形成。为此,对Os01g61900基因进行了生物信息学、亚细胞定位和组织表达分析,构建该基因的原核表达载体并进行了原核诱导表达,对它的表达产物进行了纯化。结果显示:1) Os01g61900基因编码一个细胞核定位的CCT转录因子,后者的核心区具有2个明显的α-螺旋结构;该基因在葡萄(Vitis vinifera)中存在2个同源基因,在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、玉米(Zea mays)、高粱(Sorghum bicolor)、二穗短柄草(Brachypodium distachyon)和毛果杨(Populus trichocarpa)中也存在同源基因;该基因在水稻、玉米、二穗短柄草和高粱中处在同一个进化分支上。2) Os01g61900基因在水稻的根和穗中表达量相对较高。3) 通过构建Os01g61900基因的亚细胞定位载体,经原生质体转化与烟草(Nicotiana tabacum)细胞转染发现该基因编码一个定位到细胞核的蛋白质。4) 成功构建了Os01g61900基因的原核表达载体并对该基因进行了原核诱导表达与纯化,最终在体外获得了原核表达的重组蛋白。上述研究结果为今后对Os01g61900基因功能的解析及该基因参与水稻抽穗期调控的分子机制的研究奠定了基础。

    Abstract:

    The rice (Oryza sativa) gene Os01g61900 encodes a protein containing a CCT domain. Members of this gene family are predominantly involved in regulating flowering time and thus influence heading date and final yield formation in rice. Bioinformatic analysis, subcellular localization, tissue-specific expression profiling, and prokaryotic expression vector construction were conducted for Os01g61900 , followed by prokaryotic induction and purification of its recombinant protein. Key findings include: 1) Os01g61900 encodes a nuclear-localized CCT transcription factor with two distinct α-helical structures in its core domain. Homologs of this gene were identified in grape (Vitis vinifera, two homologs), Arabidopsis thaliana, maize (Zea mays), sorghum (Sorghum bicolor), Brachypodium distachyon, and Populus trichocarpa. Phylogenetic analysis revealed that Os01g61900 clusters with homologs from maize, B. distachyon, and sorghum. 2) Os01g61900 exhibited higher expression levels in roots and panicles of rice. 3) Subcellular localization assays via protoplast transformation and tobacco (Nicotiana tabacum) cell transfection confirmed nuclear localization of the encoded protein. 4) A prokaryotic expression system was successfully established, enabling the production and purification of recombinant Os01g61900 protein in vitro. These results lay a foundation for further functional characterization of Os01g61900 and its molecular mechanism in regulating rice heading date.

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引用本文

李昀潼,吴源源,李翠萍,冯小琴,李晓薇,李明,南文斌,梁永书,张汉马,秦小健.水稻Os01g61900基因的生物信息学解析及表达分析[J].重庆师范大学学报自然科学版,2025,42(1):117-124

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  • 在线发布日期: 2025-04-07