[1]朱梦黎,张玉娟.大肠杆菌在葡萄糖和甘油碳源培养条件下的基因表达谱分析[J].重庆师范大学学报(自然科学版),2022,39(02):135.[doi:10.11721/cqnuj20220206]
ZHU Mengli,ZHANG Yujuan.Gene Expression Profling Analysis of Escherichia coli under the Conditions of Glucose and Glycerol Carbon Source Culture[J].期刊社,2022,39(02):135.[doi:10.11721/cqnuj20220206]
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ZHU Mengli,ZHANG Yujuan.Gene Expression Profling Analysis of Escherichia coli under the Conditions of Glucose and Glycerol Carbon Source Culture[J].期刊社,2022,39(02):135.[doi:10.11721/cqnuj20220206]
大肠杆菌在葡萄糖和甘油碳源培养条件下的基因表达谱分析
重庆师范大学学报（自然科学版）[ISSN:1672-6693/CN:50-1165/N]
卷:
39
期数:
2022年02期
页码:
135
栏目:
出版日期:
2022-03-25
- Title:
- Gene Expression Profling Analysis of Escherichia coli under the Conditions of Glucose and Glycerol Carbon Source Culture
- 分类号:
- Q175
- 摘要:
- 【目的】探讨葡萄糖和甘油碳源对大肠杆菌(〖WTBX〗Escherichia coli〖WTBZ〗)基因表达谱的影响。【方法】通过基因表达数据库GEO下载基因芯片数据集GSE2037和高通量测序数据集GSE156143，分别对两个数据集中的葡萄糖和甘油碳源样本进行差异表达基因筛选，对筛选到的差异表达基因进行并集后，进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析以及蛋白质相互作用网络构建。【结果】筛选出701个差异表达基因，差异表达基因主要富集于小分子分解代谢过程、碳水化合物运输、趋化性等生物学过程，细胞器、细菌型鞭毛、甲基接受趋化蛋白复合物等细胞组分，离子跨膜转运蛋白活性、碳水化合物结合、肌动活动等分子功能以及不同环境中的微生物代谢和ABC转运体相关通路。此外，筛选出的14个核心基因在鞭毛合成和趋化中发挥作用。【结论】大肠杆菌在葡萄糖和甘油碳源培养条件下具有不同的基因表达模式，所确定的14种与趋化和鞭毛合成有关的基因有助于进一步揭示大肠杆菌在应对不同营养环境变化时采取的分子调控机制。
相似文献/References:
[1]李莹,陈斌,敬俊锋,等.纳豆激酶基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达 [J].重庆师范大学学报(自然科学版),2012,29(01):77.[doi:10.11721/cqnuj20120114]
LI Ying,CHEN Bin,JING Jun-feng,et al.The Cloning of Nattokinase Gene and Its Expression in E. coli [J].期刊社,2012,29(02):77.[doi:10.11721/cqnuj20120114]
更新日期/Last Update:
2022-03-25